More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1013 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1013  integrase catalytic subunit  100 
 
 
232 aa  484  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  66.81 
 
 
270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  66.81 
 
 
270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  66.38 
 
 
270 aa  330  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  66.38 
 
 
270 aa  330  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  66.38 
 
 
270 aa  330  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  66.38 
 
 
270 aa  330  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  66.38 
 
 
270 aa  330  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  55.17 
 
 
281 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  56.41 
 
 
277 aa  261  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  50 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  50 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  54.74 
 
 
291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  51.72 
 
 
272 aa  241  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  51.29 
 
 
379 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  51.29 
 
 
272 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  52.16 
 
 
390 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  51.29 
 
 
294 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  52.16 
 
 
390 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  52.16 
 
 
390 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  52.16 
 
 
393 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  51.29 
 
 
272 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  51.29 
 
 
272 aa  237  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  48.28 
 
 
285 aa  235  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  50.86 
 
 
272 aa  235  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  234  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  234  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  234  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  48.31 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  47.41 
 
 
296 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  47.41 
 
 
296 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  47.41 
 
 
296 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  47.41 
 
 
296 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  48.31 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  48.31 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  46.15 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  46.98 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  47.44 
 
 
294 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  47.44 
 
 
294 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  47.44 
 
 
294 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  47.44 
 
 
294 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  46.58 
 
 
286 aa  232  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  50.43 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  47.44 
 
 
294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  47.41 
 
 
296 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  47.41 
 
 
296 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  48.07 
 
 
286 aa  231  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  48.07 
 
 
286 aa  231  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  48.07 
 
 
286 aa  231  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  48.07 
 
 
286 aa  231  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  48.07 
 
 
286 aa  231  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  50 
 
 
272 aa  231  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  50.66 
 
 
272 aa  231  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  50.66 
 
 
272 aa  231  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  50.66 
 
 
272 aa  231  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  50.66 
 
 
272 aa  231  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.32 
 
 
286 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.32 
 
 
286 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.32 
 
 
286 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.32 
 
 
286 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  46.32 
 
 
286 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  50 
 
 
272 aa  228  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.16 
 
 
288 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
282 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
282 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  46.78 
 
 
283 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
282 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  44.83 
 
 
291 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
282 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  44.54 
 
 
291 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  44.54 
 
 
291 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  47.88 
 
 
296 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  48.07 
 
 
286 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  47.46 
 
 
282 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>