183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0143 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 
184 aa  363  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0194  hypothetical protein  46.55 
 
 
189 aa  159  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.45339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  47.13 
 
 
182 aa  159  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1415  Appr-1-p processing domain protein  46.75 
 
 
183 aa  154  9e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  44.83 
 
 
220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0153  appr-1-p processing domain-containing protein  46.55 
 
 
179 aa  147  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  52.9 
 
 
177 aa  145  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.29 
 
 
599 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.71 
 
 
599 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  46.07 
 
 
187 aa  142  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  45.51 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  56.35 
 
 
196 aa  136  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  48.45 
 
 
178 aa  135  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  46.05 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  41.61 
 
 
181 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0694  hypothetical protein  55.28 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000693034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  43.4 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  41.32 
 
 
176 aa  124  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  37.43 
 
 
197 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0998  appr-1-p processing domain-containing protein  38.82 
 
 
175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  36.26 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  42.14 
 
 
224 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  37.89 
 
 
188 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  40.14 
 
 
178 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  36.53 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  35.84 
 
 
181 aa  111  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  46.09 
 
 
170 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  36.42 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  36.36 
 
 
183 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  36.76 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  36.84 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  35.54 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11928  lipoprotein lppD  35.06 
 
 
358 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0395522  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  41.06 
 
 
159 aa  106  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  41.09 
 
 
179 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0422  appr-1-p processing domain-containing protein  33.92 
 
 
177 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0191366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  39.04 
 
 
186 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  40 
 
 
175 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  41.86 
 
 
171 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  48.44 
 
 
185 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  37.18 
 
 
175 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  36.65 
 
 
177 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  36.31 
 
 
184 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  35.71 
 
 
196 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  36.69 
 
 
175 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  34.91 
 
 
173 aa  101  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  34.13 
 
 
163 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  41.27 
 
 
180 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05810  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  48.84 
 
 
178 aa  100  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.198102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  34.64 
 
 
186 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  36.55 
 
 
183 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  32.09 
 
 
190 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3185  appr-1-p processing domain-containing protein  42.64 
 
 
577 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35791  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  41.73 
 
 
172 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  31.46 
 
 
199 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  33.55 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  33.55 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  32.95 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  33.55 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0909  appr-1-p processing domain-containing protein  31.55 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0449366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  34.36 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6160  hypothetical protein  43.18 
 
 
174 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506292  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  33.55 
 
 
179 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  34.64 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  33.55 
 
 
179 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  33.9 
 
 
180 aa  98.6  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  34.55 
 
 
174 aa  97.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  34.21 
 
 
187 aa  97.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3405  Appr-1-p processing domain protein  40 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  31.76 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0554  Appr-1-p processing domain protein  34.97 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  43.8 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  34.57 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  32.77 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  43.28 
 
 
177 aa  95.9  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  36.84 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  31.58 
 
 
177 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  32.34 
 
 
175 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  31.71 
 
 
173 aa  94.7  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  32.12 
 
 
173 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  30.23 
 
 
177 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  31.74 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  38.17 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  32.34 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  31.06 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  32.72 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  33.74 
 
 
174 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  31.74 
 
 
170 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  36.36 
 
 
190 aa  92  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0191  Appr-1-p processing domain protein  33.33 
 
 
341 aa  91.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  35.06 
 
 
173 aa  91.3  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  32.52 
 
 
174 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0374  hypothetical protein  35.26 
 
 
266 aa  91.3  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0384  hypothetical protein  35.26 
 
 
266 aa  91.3  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  35 
 
 
172 aa  90.9  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  36.51 
 
 
181 aa  90.9  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  31.9 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  31.9 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  33.77 
 
 
177 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  34.03 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>