179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3405 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3405  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 
193 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0073  Appr-1-p processing domain protein  63.19 
 
 
175 aa  192  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00241191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  57.06 
 
 
173 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  55.68 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  54.91 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  56.89 
 
 
175 aa  170  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  56.4 
 
 
170 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05810  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  61.33 
 
 
178 aa  167  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.198102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  56.1 
 
 
173 aa  165  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  50.83 
 
 
175 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  59.54 
 
 
171 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  47.02 
 
 
224 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  53.41 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  49.44 
 
 
175 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  52.05 
 
 
196 aa  150  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6160  hypothetical protein  54.71 
 
 
174 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506292  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4618  Appr-1-p processing domain protein  60 
 
 
170 aa  147  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  55.41 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3185  appr-1-p processing domain-containing protein  58.46 
 
 
577 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35791  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  52.73 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  47.12 
 
 
199 aa  145  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  47.93 
 
 
173 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  51.88 
 
 
173 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  46.24 
 
 
195 aa  141  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  43.02 
 
 
186 aa  140  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  43.53 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  41.01 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  45.03 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  40 
 
 
190 aa  138  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  46.33 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  47.13 
 
 
177 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  43.53 
 
 
174 aa  136  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  52.45 
 
 
173 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  50.29 
 
 
183 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  46.67 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  44.19 
 
 
194 aa  135  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  47.09 
 
 
170 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  52.21 
 
 
164 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  41.11 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  48.84 
 
 
171 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  42.26 
 
 
173 aa  132  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  48.5 
 
 
174 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  46.55 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  51.53 
 
 
180 aa  131  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  48.28 
 
 
176 aa  131  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  48.5 
 
 
174 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  44.06 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  50 
 
 
183 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  45.28 
 
 
177 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  45.71 
 
 
186 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  47.09 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  47.43 
 
 
182 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  47.09 
 
 
179 aa  127  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  47.95 
 
 
183 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  48.84 
 
 
177 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  48.84 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  48.84 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  48.84 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  47.9 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  48.84 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  50 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  48.84 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  48.84 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  50.35 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  45.36 
 
 
171 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  47.34 
 
 
173 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  42.86 
 
 
179 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  43.11 
 
 
174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  44.77 
 
 
175 aa  124  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  40.7 
 
 
167 aa  124  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  45.09 
 
 
186 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  50 
 
 
174 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
174 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  45.51 
 
 
190 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  42.42 
 
 
176 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  49.36 
 
 
174 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  48 
 
 
184 aa  121  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  46.59 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  46.59 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  48.26 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  46.59 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  46.59 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  45.4 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  46.59 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  46.59 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  46.59 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  43.6 
 
 
374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  43.48 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  46.59 
 
 
177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  46.02 
 
 
177 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  39.66 
 
 
184 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  41.18 
 
 
180 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  46.47 
 
 
177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  42.86 
 
 
176 aa  118  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  44.51 
 
 
177 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000896  hypothetical protein  44.19 
 
 
170 aa  117  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  40.59 
 
 
173 aa  117  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  45.29 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  42.11 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>