181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0197 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  347  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  86.55 
 
 		 170 aa  295  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  81.29 
 
 		 171 aa  290  9e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  68.94 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  66.26 
 
 		 171 aa  206  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  66.88 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  57.65 
 
 		 194 aa  205  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  61.25 
 
 		 163 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  57.06 
 
 		 173 aa  198  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  64.38 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  63.75 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  60.84 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  56.79 
 
 		 175 aa  193  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  60.48 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  58.39 
 
 		 175 aa  190  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  62.87 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  61.64 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  60.12 
 
 		 183 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  61.88 
 
 		 188 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  60.36 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  58.39 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  61.88 
 
 		 188 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  61.88 
 
 		 188 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  61.88 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  58.49 
 
 		 174 aa  185  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  61.88 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  61.88 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  65.91 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  60.48 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  59.64 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  61.25 
 
 		 177 aa  183  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  65.38 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  60.53 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  59.87 
 
 		 174 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  54.6 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  56.21 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  59.04 
 
 		 174 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  57.76 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  64.03 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  58.43 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  58.43 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  56.25 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  56.25 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  64.56 
 
 		 193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  56.88 
 
 		 177 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  57.83 
 
 		 174 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  57.83 
 
 		 174 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  54.6 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  56.97 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  54.6 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  54.6 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  55.83 
 
 		 175 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  53.99 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  50.92 
 
 		 167 aa  170  6.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  53.99 
 
 		 179 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  58.39 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  54.14 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  51.52 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  48.54 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  52.12 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  58.28 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  57.23 
 
 		 174 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  51.16 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  54.43 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  59.87 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  64.52 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  57.14 
 
 		 169 aa  164  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  52.76 
 
 		 195 aa  164  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  50.87 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  52.94 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  54.36 
 
 		 173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  53.89 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  50.94 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  50.59 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  50.59 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39320  Appr-1-p processing protein  62.26 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92966  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  50.59 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  50.59 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  50.59 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  50.59 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  50.59 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  50.59 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  53.29 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  50 
 
 		 186 aa  157  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  44.44 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  48.81 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  52.44 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  51.16 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  50.33 
 
 		 170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  51.52 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  49.09 
 
 		 374 aa  150  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  54.72 
 
 		 183 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  47.65 
 
 		 180 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  50.62 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  57.04 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0484  Appr-1-p processing domain protein  58.14 
 
 		 202 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  49.02 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  55.33 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00650  conserved hypothetical protein  49.36 
 
 		 252 aa  141  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>