180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4618 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4618  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 
170 aa  328  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  66.07 
 
 
173 aa  207  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  61.9 
 
 
170 aa  198  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  60.71 
 
 
171 aa  195  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  65.66 
 
 
171 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  61.64 
 
 
185 aa  189  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  63.41 
 
 
197 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  62.21 
 
 
175 aa  186  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  65.43 
 
 
173 aa  181  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6160  hypothetical protein  61.08 
 
 
174 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506292  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  62.35 
 
 
177 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  54.6 
 
 
175 aa  170  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  52.87 
 
 
224 aa  164  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0073  Appr-1-p processing domain protein  58.67 
 
 
175 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00241191  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  51.16 
 
 
199 aa  154  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  45.61 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  51.85 
 
 
192 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  49.7 
 
 
173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3405  Appr-1-p processing domain protein  68 
 
 
193 aa  144  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  43.45 
 
 
174 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  141  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  48.24 
 
 
177 aa  141  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  141  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  141  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  141  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  141  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  141  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  140  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  47.65 
 
 
177 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  49.41 
 
 
196 aa  138  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3185  appr-1-p processing domain-containing protein  49.4 
 
 
577 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35791  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  44.44 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05810  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  59.76 
 
 
178 aa  137  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.198102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  45.34 
 
 
177 aa  135  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  42.17 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  49.41 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  46.15 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  46.24 
 
 
186 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  44.38 
 
 
176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  44.44 
 
 
195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000896  hypothetical protein  48.17 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  49.1 
 
 
171 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  44.52 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  44.51 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  51.94 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  44.03 
 
 
183 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  43.11 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  40.83 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  43.71 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  46.99 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  48.39 
 
 
173 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  49.09 
 
 
174 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  47.95 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  47.1 
 
 
173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  47.65 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  41.57 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  47.59 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  46.2 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  46.39 
 
 
177 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  45.45 
 
 
177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  43.2 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  45.24 
 
 
181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  42.59 
 
 
176 aa  127  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  42.35 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  42.35 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  53.28 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  40.59 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  42.35 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  39.76 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  42.35 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  42.35 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  42.26 
 
 
186 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  48.63 
 
 
163 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  51.08 
 
 
183 aa  123  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  47.93 
 
 
184 aa  123  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  49.4 
 
 
177 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  44.17 
 
 
175 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  46.99 
 
 
177 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  46.99 
 
 
177 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  44.44 
 
 
176 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  46.99 
 
 
188 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  45.88 
 
 
173 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  46.99 
 
 
177 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  46.99 
 
 
177 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  46.99 
 
 
188 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  46.99 
 
 
188 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  49.69 
 
 
193 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  43.29 
 
 
181 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  47.17 
 
 
173 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  43.9 
 
 
173 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  42.51 
 
 
172 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  37.95 
 
 
190 aa  120  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  44.12 
 
 
170 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  44.74 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  40.72 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  45.78 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  45.32 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  47.37 
 
 
173 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  46.47 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  41.04 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>