181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0425 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 
181 aa  366  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  83.33 
 
 
181 aa  306  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  55.36 
 
 
175 aa  181  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  54.12 
 
 
174 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  51.48 
 
 
175 aa  174  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  55.97 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  52.6 
 
 
173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  56.98 
 
 
184 aa  171  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  51.14 
 
 
184 aa  168  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  49.71 
 
 
175 aa  168  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  52.15 
 
 
175 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  53.09 
 
 
195 aa  168  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  52.47 
 
 
181 aa  168  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  54.09 
 
 
173 aa  167  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  53.18 
 
 
186 aa  166  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  50.62 
 
 
167 aa  166  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  52.12 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  53.01 
 
 
177 aa  164  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  53.42 
 
 
177 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  48.19 
 
 
173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  56.86 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  52.98 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  48.78 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  52.41 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  51.81 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  52.8 
 
 
177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  50.6 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  55.1 
 
 
194 aa  159  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  48.17 
 
 
173 aa  158  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  64.89 
 
 
166 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  49.69 
 
 
172 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  53.89 
 
 
184 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  51.88 
 
 
164 aa  156  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  58.96 
 
 
163 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  52.73 
 
 
173 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  50.31 
 
 
190 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  54.3 
 
 
173 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  52.15 
 
 
180 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  50.9 
 
 
173 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  51.5 
 
 
183 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  49.07 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  49.71 
 
 
176 aa  154  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  50.3 
 
 
174 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  46.86 
 
 
179 aa  154  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  44.57 
 
 
176 aa  153  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  50.57 
 
 
179 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  50.57 
 
 
179 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  50.97 
 
 
176 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  51.85 
 
 
171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  51.52 
 
 
171 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  49.12 
 
 
171 aa  150  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  49.1 
 
 
174 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  50.33 
 
 
177 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  50.89 
 
 
182 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  49.7 
 
 
182 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
193 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  57.35 
 
 
170 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  46.99 
 
 
183 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  43.96 
 
 
183 aa  148  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  50.99 
 
 
173 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  47.93 
 
 
187 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  51.53 
 
 
173 aa  147  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  52.15 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  45.03 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  47.31 
 
 
170 aa  145  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0909  appr-1-p processing domain-containing protein  46.29 
 
 
181 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0449366  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  48.26 
 
 
171 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  48.5 
 
 
178 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  144  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  45.71 
 
 
188 aa  144  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  47.9 
 
 
174 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00650  conserved hypothetical protein  46.34 
 
 
252 aa  142  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  46.67 
 
 
197 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  48.81 
 
 
199 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0164  Appr-1-p processing domain protein  47.83 
 
 
173 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.322732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  47.53 
 
 
170 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  46.47 
 
 
177 aa  141  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  47.31 
 
 
174 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  50 
 
 
180 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  46.71 
 
 
174 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  46.71 
 
 
174 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  46.95 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  54.55 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  47.67 
 
 
177 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  47.62 
 
 
177 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  52.73 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  46.71 
 
 
174 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  46.55 
 
 
180 aa  137  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39320  Appr-1-p processing protein  62.18 
 
 
167 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  45.45 
 
 
177 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  44.44 
 
 
175 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  45.45 
 
 
177 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  45.83 
 
 
177 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  45.83 
 
 
177 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  45.83 
 
 
177 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  45.83 
 
 
188 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  45.45 
 
 
177 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>