181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4194 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  83.33 
 
 		 181 aa  306  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  52.87 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  59.62 
 
 		 174 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  54.29 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  49.4 
 
 		 173 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  51.2 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  56.02 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  51.53 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  52.94 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  55 
 
 		 195 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  55.62 
 
 		 173 aa  170  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  54.82 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  51.18 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  52.98 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  55.37 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  49.14 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  52.1 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  53.7 
 
 		 168 aa  165  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  52.63 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  57.52 
 
 		 172 aa  164  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  57.24 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  51.88 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  49.69 
 
 		 167 aa  162  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  54.04 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  52.69 
 
 		 183 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  48.15 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  49.71 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  53.01 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  56.25 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  54.76 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  56.33 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  53.42 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  55.63 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  48.78 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  51.5 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  52.76 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  46.86 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  53.33 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  53.64 
 
 		 173 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  52.12 
 
 		 174 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  52.12 
 
 		 173 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  62.1 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  49.69 
 
 		 190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  52.12 
 
 		 174 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  51.5 
 
 		 174 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  52.15 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  52.76 
 
 		 179 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  52.76 
 
 		 179 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  51.9 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  51.48 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  52.15 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  52.15 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  56.3 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  50.3 
 
 		 182 aa  151  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  51.5 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  50.32 
 
 		 176 aa  151  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  43.43 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  53.33 
 
 		 180 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  51.74 
 
 		 193 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  49.67 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  51.57 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  47.98 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  48.17 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  51.85 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  57.04 
 
 		 171 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  52.6 
 
 		 174 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  52.6 
 
 		 174 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  52.94 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  47.88 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  52.94 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  48.45 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  49.13 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00650  conserved hypothetical protein  47.56 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110793  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  48.24 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  51.33 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  44.51 
 
 		 183 aa  144  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  53.57 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  51.92 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  49.69 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  48.45 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0164  Appr-1-p processing domain protein  47.77 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.322732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  47.13 
 
 		 175 aa  141  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  48.82 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  48.82 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  48.82 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  48.82 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  48.82 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  48.82 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  43.18 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  46.06 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  46.06 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  46.06 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  46.06 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  46.06 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  46.06 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  46.06 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>