182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2058 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  100 
 
 		 175 aa  361  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  67.66 
 
 		 173 aa  253  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  65.48 
 
 		 175 aa  243  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  66.67 
 
 		 174 aa  240  7.999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  67.86 
 
 		 176 aa  238  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  69.28 
 
 		 177 aa  234  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  68.12 
 
 		 174 aa  230  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  65.64 
 
 		 164 aa  219  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  60.12 
 
 		 177 aa  215  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  61.31 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  61.73 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  61.25 
 
 		 177 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  60 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  59.88 
 
 		 175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  58.49 
 
 		 173 aa  211  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  59.04 
 
 		 173 aa  211  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  56.63 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  58.75 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  56.29 
 
 		 183 aa  207  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  61.54 
 
 		 176 aa  207  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  55.62 
 
 		 195 aa  206  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  56.55 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  58.28 
 
 		 194 aa  203  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  58.08 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  57.76 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  62.42 
 
 		 177 aa  200  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  62.67 
 
 		 163 aa  200  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  61.54 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  59.48 
 
 		 174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  56.17 
 
 		 171 aa  197  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  61.15 
 
 		 168 aa  197  9e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  58.14 
 
 		 174 aa  197  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  55.97 
 
 		 171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  59.17 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  55.21 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  58.82 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  57.06 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  54.44 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  60.53 
 
 		 173 aa  194  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  60.78 
 
 		 173 aa  194  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  55.49 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  55.49 
 
 		 177 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  55.49 
 
 		 177 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  55.49 
 
 		 177 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  55.49 
 
 		 177 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  55.49 
 
 		 177 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  55.49 
 
 		 177 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  55.49 
 
 		 177 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  56.79 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  57.86 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  57.86 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  57.86 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  57.86 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  57.86 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  57.86 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  57.86 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  54.94 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  54.88 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  57.52 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  55.36 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  56.36 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  56.52 
 
 		 169 aa  188  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  56.86 
 
 		 174 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  56.86 
 
 		 174 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  58.97 
 
 		 182 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  55.49 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  58.17 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  56.86 
 
 		 182 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  58.43 
 
 		 188 aa  184  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  55.49 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  54.88 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  55.49 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  54.9 
 
 		 174 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  54.88 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  55.56 
 
 		 174 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  57.83 
 
 		 172 aa  184  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  54.88 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  54.27 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  54.25 
 
 		 174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  50.89 
 
 		 176 aa  181  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  49.43 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  56.29 
 
 		 173 aa  180  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  49.44 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  53.99 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  50 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  53.66 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  56.29 
 
 		 173 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  51.48 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  51.2 
 
 		 181 aa  172  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  51.18 
 
 		 374 aa  170  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  53.59 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  53.33 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00650  conserved hypothetical protein  51.83 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  48.5 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  47.9 
 
 		 186 aa  165  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  50.87 
 
 		 171 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39320  Appr-1-p processing protein  54.37 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92966  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  49.43 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  48.81 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  52.15 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>