182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2235 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  73.78 
 
 
173 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  68.29 
 
 
170 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  65.66 
 
 
171 aa  228  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  68.29 
 
 
171 aa  213  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  63.03 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  64.94 
 
 
224 aa  210  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  67.07 
 
 
177 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6160  hypothetical protein  62.65 
 
 
174 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506292  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  62.87 
 
 
173 aa  201  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  61.15 
 
 
175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  59.65 
 
 
175 aa  192  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4618  Appr-1-p processing domain protein  64.15 
 
 
170 aa  188  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  52.33 
 
 
174 aa  174  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  54.94 
 
 
196 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  52.15 
 
 
183 aa  167  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  49.43 
 
 
186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  50.29 
 
 
175 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0073  Appr-1-p processing domain protein  58.33 
 
 
175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00241191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  53.29 
 
 
177 aa  158  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  46.55 
 
 
175 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3185  appr-1-p processing domain-containing protein  53.46 
 
 
577 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35791  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  57.97 
 
 
180 aa  154  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  64.06 
 
 
172 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  49.4 
 
 
188 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  45.45 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3405  Appr-1-p processing domain protein  50.61 
 
 
193 aa  151  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  49.41 
 
 
195 aa  150  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  52.35 
 
 
171 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  50.62 
 
 
180 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  54.14 
 
 
173 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  51.25 
 
 
168 aa  150  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  48.52 
 
 
181 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  49.7 
 
 
173 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  53.37 
 
 
171 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  50.31 
 
 
177 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  55.32 
 
 
176 aa  148  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  52.41 
 
 
174 aa  148  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  52.76 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  45.35 
 
 
174 aa  145  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  47.37 
 
 
176 aa  145  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  51.16 
 
 
177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  45.88 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  48.04 
 
 
194 aa  144  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  47.62 
 
 
179 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  47.62 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  47.73 
 
 
175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  47.62 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  47.02 
 
 
179 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  47.2 
 
 
181 aa  143  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  47.02 
 
 
179 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  48.52 
 
 
180 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  48.52 
 
 
181 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  49.7 
 
 
164 aa  142  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  47.06 
 
 
186 aa  140  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  51.22 
 
 
192 aa  140  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  46.78 
 
 
177 aa  140  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  50 
 
 
177 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  48.54 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  50.29 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  47.93 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  48.26 
 
 
177 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  48.26 
 
 
177 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  48.26 
 
 
177 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  48.26 
 
 
177 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  48.26 
 
 
177 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  48.26 
 
 
177 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  48.26 
 
 
177 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  48.26 
 
 
177 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  43.53 
 
 
179 aa  137  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  47.27 
 
 
167 aa  137  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  47.67 
 
 
177 aa  137  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  137  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  47.37 
 
 
177 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  44.71 
 
 
176 aa  136  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  50.3 
 
 
173 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  48.05 
 
 
163 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05810  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  54.71 
 
 
178 aa  136  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.198102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  49.68 
 
 
173 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  48.1 
 
 
175 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  49.68 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000896  hypothetical protein  46.45 
 
 
170 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  48.15 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  42.35 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  42.26 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  44.97 
 
 
179 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  49.4 
 
 
166 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  50.61 
 
 
193 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  47.27 
 
 
184 aa  131  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  49.7 
 
 
173 aa  131  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  45.29 
 
 
183 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  49.7 
 
 
173 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  45.45 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00650  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 
252 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110793  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  43.79 
 
 
187 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  43.86 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  54.14 
 
 
176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  46.34 
 
 
186 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  47.31 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  47.06 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>