182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4662 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 
175 aa  353  7.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  65.82 
 
 
197 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  62.13 
 
 
173 aa  218  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  60.24 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  60.95 
 
 
171 aa  217  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  63.69 
 
 
170 aa  204  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  62.87 
 
 
196 aa  200  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  68.61 
 
 
175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  59.62 
 
 
173 aa  190  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6160  hypothetical protein  55.75 
 
 
174 aa  187  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506292  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  60.26 
 
 
177 aa  186  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  61.54 
 
 
185 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  59.49 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  50.29 
 
 
183 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3185  appr-1-p processing domain-containing protein  57.23 
 
 
577 aa  168  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35791  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0073  Appr-1-p processing domain protein  55.26 
 
 
175 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00241191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3405  Appr-1-p processing domain protein  55.13 
 
 
193 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4618  Appr-1-p processing domain protein  54.94 
 
 
170 aa  154  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  47.24 
 
 
186 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  48.47 
 
 
175 aa  154  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  56.93 
 
 
175 aa  153  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  48.24 
 
 
180 aa  150  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  52.5 
 
 
164 aa  149  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  45.03 
 
 
177 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  48.47 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  57.69 
 
 
172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  46.3 
 
 
180 aa  144  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  46.99 
 
 
188 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  46.96 
 
 
199 aa  144  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05810  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  61.42 
 
 
178 aa  144  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.198102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  49.36 
 
 
177 aa  143  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  47.59 
 
 
175 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  50.7 
 
 
168 aa  140  8e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  54.74 
 
 
177 aa  140  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  54.74 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  52.17 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  51.75 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  52.45 
 
 
173 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  45.83 
 
 
186 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  50.76 
 
 
190 aa  137  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  47.62 
 
 
173 aa  137  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  51.82 
 
 
195 aa  137  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  56.92 
 
 
174 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  51.43 
 
 
174 aa  137  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  48.73 
 
 
174 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  50.32 
 
 
192 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  45.09 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  53.85 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  53.85 
 
 
174 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  53.85 
 
 
174 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  53.85 
 
 
174 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  54.29 
 
 
173 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000896  hypothetical protein  43.83 
 
 
170 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  53.85 
 
 
174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  46.2 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  50.71 
 
 
171 aa  131  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  42.94 
 
 
173 aa  130  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  52.31 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  55.12 
 
 
176 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  48.95 
 
 
172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  42.69 
 
 
181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  43.6 
 
 
183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  54.4 
 
 
177 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  46.88 
 
 
181 aa  127  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  44.79 
 
 
171 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  42.13 
 
 
179 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  51.52 
 
 
177 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  54.55 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  42.13 
 
 
179 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  44.72 
 
 
181 aa  127  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  41.86 
 
 
179 aa  127  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  42.13 
 
 
179 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  42.13 
 
 
179 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  46.58 
 
 
186 aa  127  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  51.52 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  51.94 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  40.91 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  51.45 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  46.45 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  51.52 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  51.52 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  42.13 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  40.91 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  40.91 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  51.52 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  46.71 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  53.85 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  40.91 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  40.91 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  40.91 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  51.52 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  51.52 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  40.91 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  40.91 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  40.91 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  40.91 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  46.75 
 
 
177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  46.63 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  42.94 
 
 
170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>