181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2238 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  100 
 
 
174 aa  347  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  347  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  98.28 
 
 
174 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  94.25 
 
 
174 aa  329  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  91.38 
 
 
174 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  91.38 
 
 
174 aa  317  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  89.02 
 
 
174 aa  308  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  66.47 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  67.05 
 
 
182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  66.47 
 
 
182 aa  231  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  68.75 
 
 
177 aa  231  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  66.67 
 
 
177 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  66.48 
 
 
177 aa  221  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  66.48 
 
 
188 aa  221  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  66.48 
 
 
177 aa  221  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  66.48 
 
 
177 aa  221  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  66.48 
 
 
188 aa  221  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  66.48 
 
 
188 aa  221  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  64.71 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  58.82 
 
 
186 aa  203  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  61.04 
 
 
175 aa  200  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  66.67 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  64.33 
 
 
177 aa  198  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  68.97 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  68.28 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  57.89 
 
 
194 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  67.12 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  63.69 
 
 
177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  67.3 
 
 
171 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  61.08 
 
 
190 aa  195  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  64.05 
 
 
174 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  59.75 
 
 
172 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  62.35 
 
 
180 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  60.14 
 
 
176 aa  191  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  54.55 
 
 
195 aa  189  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  63.69 
 
 
183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  56.86 
 
 
175 aa  188  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  55.84 
 
 
173 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  56.65 
 
 
175 aa  185  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  63.35 
 
 
169 aa  185  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  59.75 
 
 
163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  60.39 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  59.35 
 
 
164 aa  181  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  58.02 
 
 
173 aa  181  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  59.28 
 
 
170 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  62.5 
 
 
193 aa  178  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  60.54 
 
 
183 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  56.85 
 
 
177 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  52.23 
 
 
174 aa  175  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  54.9 
 
 
173 aa  174  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  57.23 
 
 
177 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  56.47 
 
 
171 aa  174  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  48.55 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  56.65 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  53.42 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  56.79 
 
 
168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  57.83 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  70.09 
 
 
176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  59.01 
 
 
177 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39320  Appr-1-p processing protein  62.99 
 
 
167 aa  167  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92966  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  66.67 
 
 
166 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  53.99 
 
 
199 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  59.74 
 
 
173 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  56.89 
 
 
173 aa  163  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  55.69 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  47.77 
 
 
167 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  50.9 
 
 
172 aa  157  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  52.1 
 
 
180 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  44.89 
 
 
180 aa  155  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  48.85 
 
 
186 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  48.41 
 
 
184 aa  152  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  51.83 
 
 
172 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  49.39 
 
 
179 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  54.04 
 
 
179 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  54.04 
 
 
179 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  53.42 
 
 
179 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  53.42 
 
 
179 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  53.42 
 
 
179 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  53.25 
 
 
374 aa  149  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  50.32 
 
 
174 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  52.2 
 
 
192 aa  148  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  42.94 
 
 
188 aa  148  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  50.31 
 
 
177 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  50.31 
 
 
177 aa  148  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  50.31 
 
 
177 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  50.31 
 
 
177 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  50.31 
 
 
177 aa  148  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  50.31 
 
 
177 aa  148  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  50.31 
 
 
177 aa  148  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  50.31 
 
 
177 aa  148  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  50 
 
 
170 aa  147  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  52.6 
 
 
181 aa  147  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  49.69 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00650  conserved hypothetical protein  48.39 
 
 
252 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  49.4 
 
 
176 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  51.33 
 
 
170 aa  140  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  50.58 
 
 
183 aa  140  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  46.71 
 
 
181 aa  140  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  51.61 
 
 
179 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  47.02 
 
 
187 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>