180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1600 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  100 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  70.52 
 
 		 180 aa  247  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  63.22 
 
 		 186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  59.41 
 
 		 194 aa  213  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  62.79 
 
 		 174 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  65.24 
 
 		 177 aa  207  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  63.64 
 
 		 173 aa  207  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  62.35 
 
 		 174 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  62.35 
 
 		 174 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  60.98 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  63.31 
 
 		 171 aa  204  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  64.63 
 
 		 177 aa  203  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  61.76 
 
 		 174 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  66.23 
 
 		 173 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  64.9 
 
 		 173 aa  202  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  61.27 
 
 		 174 aa  201  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  64.02 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  60.69 
 
 		 174 aa  200  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  59.15 
 
 		 174 aa  200  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  61.18 
 
 		 174 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  61.35 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  62.35 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  62.35 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  62.35 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  62.35 
 
 		 177 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  62.35 
 
 		 177 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  62.35 
 
 		 177 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  61.64 
 
 		 177 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  58.17 
 
 		 175 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  60.12 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  59.06 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  61.96 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  60.54 
 
 		 175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  59.51 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  60.12 
 
 		 182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  57.74 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  63.12 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  55.9 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  59.17 
 
 		 170 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  58.9 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  56.52 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  57.99 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  51.25 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  57.93 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  60.78 
 
 		 175 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  54.04 
 
 		 174 aa  186  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  57.23 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  56.21 
 
 		 171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  57.89 
 
 		 183 aa  181  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  53.66 
 
 		 195 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  67.15 
 
 		 166 aa  180  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  55.97 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  59.88 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  56.88 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  52.8 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  53.59 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3703  Appr-1-p processing  74.56 
 
 		 127 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  50.6 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  50.6 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  53.95 
 
 		 173 aa  170  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  48.17 
 
 		 167 aa  170  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  55.15 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  55.95 
 
 		 173 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  63.11 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  53.33 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  59.21 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  49.04 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  52.98 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  50.61 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  47.95 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  52.5 
 
 		 374 aa  156  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  50.31 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  51.22 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  50.31 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  49.69 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  51.22 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  51.22 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  49.69 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  51.22 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  51.22 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  49.69 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  51.22 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  51.22 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  51.22 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39320  Appr-1-p processing protein  66.12 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  50.61 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  49.04 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  55.35 
 
 		 183 aa  151  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  47.95 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  44.31 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0484  Appr-1-p processing domain protein  50.63 
 
 		 202 aa  148  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  49.12 
 
 		 170 aa  148  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  48.8 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  48.73 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1761  Appr-1-p processing  70.1 
 
 		 98 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492968  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  45.83 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  48.02 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>