164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1761 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1761  Appr-1-p processing  100 
 
 		 98 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492968  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3703  Appr-1-p processing  84.52 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  70.41 
 
 		 180 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  70.1 
 
 		 180 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  58.76 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  62.5 
 
 		 177 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  60 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  61.05 
 
 		 177 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  60 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  52.63 
 
 		 173 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  50.51 
 
 		 194 aa  110  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  54.17 
 
 		 190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  53.68 
 
 		 173 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  52.75 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  53.61 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  52.63 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  54.74 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  50.59 
 
 		 175 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  58.33 
 
 		 193 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  54.64 
 
 		 171 aa  98.6  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  51.58 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  56.47 
 
 		 174 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  51.55 
 
 		 171 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  52.13 
 
 		 183 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  52.63 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  52.63 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  53.12 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  52.63 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  49.41 
 
 		 176 aa  94.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  52.13 
 
 		 172 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  48.81 
 
 		 175 aa  93.6  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  51.04 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  48.42 
 
 		 177 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  41.84 
 
 		 173 aa  89.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  66.67 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  52.04 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  49.41 
 
 		 183 aa  88.6  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  41.05 
 
 		 174 aa  87.8  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  48.98 
 
 		 180 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  42.11 
 
 		 177 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  53.19 
 
 		 184 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  43.62 
 
 		 167 aa  86.7  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  52.58 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  52.58 
 
 		 188 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  46.32 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  52.58 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  52.58 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  52.58 
 
 		 188 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  52.58 
 
 		 188 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  47.37 
 
 		 182 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  51.02 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  45.83 
 
 		 186 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  68.85 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  43.01 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  51.19 
 
 		 164 aa  84  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0484  Appr-1-p processing domain protein  59.42 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  44.68 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  51.22 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  46.15 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  39.58 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  47.96 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  43.37 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  44.68 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  51.16 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  44.33 
 
 		 199 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  44.57 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  41.05 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  41.05 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  41.05 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  41.05 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  41.05 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  41.05 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  41.05 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  41.05 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  41.05 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  43.88 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  47.56 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  40.62 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  50.57 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1415  Appr-1-p processing domain protein  40.66 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  43.75 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  36.84 
 
 		 176 aa  77  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  35 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  34.07 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  42.11 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  42.11 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  41.05 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  41.05 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  41.05 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  41.05 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  54.1 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0554  Appr-1-p processing domain protein  50.72 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  38.78 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  41.05 
 
 		 195 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  48.42 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  41.05 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39320  Appr-1-p processing protein  44.9 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  37.21 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>