172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3703 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3703  Appr-1-p processing  100 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  75.2 
 
 		 180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  73.6 
 
 		 180 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1761  Appr-1-p processing  83.51 
 
 		 98 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492968  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  58.73 
 
 		 186 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  65.32 
 
 		 177 aa  156  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  63.41 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  64.17 
 
 		 177 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  53.17 
 
 		 194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  58.06 
 
 		 190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  60.53 
 
 		 174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  57.98 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  58.2 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  60.8 
 
 		 171 aa  141  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  58.87 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  57.6 
 
 		 174 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  55.36 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  57.72 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  58.54 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  54.46 
 
 		 175 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  56.91 
 
 		 174 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  57.38 
 
 		 183 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  57.72 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  57.72 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  59.68 
 
 		 193 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  60.66 
 
 		 184 aa  134  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  55.2 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  57.72 
 
 		 174 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  57.14 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  55.74 
 
 		 177 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  53.51 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  57.6 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  54.92 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  51.97 
 
 		 173 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  59.09 
 
 		 173 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  51.64 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  53.28 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  47.54 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  57.27 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  56 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  56 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  46.61 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  46.72 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  56 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  56 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  55.2 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  56 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  56 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  51.67 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  48.82 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  53.39 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  52.46 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  52.71 
 
 		 186 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  49.59 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  50 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  53.1 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  50.42 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  44.54 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  49.17 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  50.82 
 
 		 173 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  54.62 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  49.53 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  52.25 
 
 		 181 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  54.47 
 
 		 169 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  54.55 
 
 		 181 aa  113  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  45.53 
 
 		 195 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39320  Appr-1-p processing protein  51.64 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92966  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  42.62 
 
 		 176 aa  111  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  44.44 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0484  Appr-1-p processing domain protein  50.85 
 
 		 202 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  41.13 
 
 		 184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  45 
 
 		 176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  45.76 
 
 		 374 aa  106  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  43.51 
 
 		 177 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  44.27 
 
 		 199 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  43.51 
 
 		 177 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  43.51 
 
 		 177 aa  103  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  43.51 
 
 		 177 aa  103  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  43.51 
 
 		 177 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  43.51 
 
 		 177 aa  103  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  45.69 
 
 		 174 aa  103  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  43.51 
 
 		 177 aa  103  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  43.51 
 
 		 177 aa  103  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  39.55 
 
 		 180 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  42.75 
 
 		 177 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  44.74 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  47.15 
 
 		 184 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  50.43 
 
 		 180 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  44.44 
 
 		 180 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  49.18 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  47.75 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  43.1 
 
 		 187 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0554  Appr-1-p processing domain protein  46.02 
 
 		 188 aa  97.1  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00650  conserved hypothetical protein  38.4 
 
 		 252 aa  96.3  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  43.86 
 
 		 188 aa  96.7  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  44.17 
 
 		 181 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  47.5 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  45.08 
 
 		 179 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  45.08 
 
 		 179 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  44.26 
 
 		 179 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>