179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0554 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0554  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0484  Appr-1-p processing domain protein  51.15 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  45.86 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2123  Appr-1-p processing  49.41 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  49.39 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  44.94 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  48.78 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  47.56 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  46.82 
 
 		 175 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  48.78 
 
 		 179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  48.5 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  44.71 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  53.47 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  56.83 
 
 		 171 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  48.19 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  47.34 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  48.17 
 
 		 195 aa  147  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  53.47 
 
 		 177 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  43.68 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  54.17 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  53.79 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  49.39 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  54.48 
 
 		 163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  53.1 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  49.01 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  50.31 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  48.39 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  45.61 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  48.41 
 
 		 177 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  47.09 
 
 		 183 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  144  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  44.07 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  43.5 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  47.77 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  43.35 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  54.74 
 
 		 171 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  56.92 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  46.15 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  42.29 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  45.56 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  54.81 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  54.81 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  48.84 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  43.75 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  54.81 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  54.81 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  54.81 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  54.81 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  55.97 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  44.38 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  47.17 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  52.45 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  42.17 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  48.12 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  51.09 
 
 		 179 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  45.73 
 
 		 173 aa  138  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  48.52 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  48.55 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  51.8 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  44.44 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  54.07 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  48.77 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  52.53 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  45.06 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  50.7 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  51.06 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  51.08 
 
 		 170 aa  131  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  43.29 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  46.34 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  45.4 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  45 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  54.48 
 
 		 173 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  43.2 
 
 		 174 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  46.15 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  43.56 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  43.03 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.37 
 
 		 599 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1415  Appr-1-p processing domain protein  41.29 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  42.6 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  50 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.62 
 
 		 599 aa  125  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  49.65 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  43.62 
 
 		 182 aa  124  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  38.71 
 
 		 182 aa  124  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  38.51 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  49.63 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0164  Appr-1-p processing domain protein  42.94 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.322732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 		 172 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  44.17 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  48.94 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  48.94 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39320  Appr-1-p processing protein  55.56 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>