184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2547 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  71.69 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  67.27 
 
 		 175 aa  231  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0909  appr-1-p processing domain-containing protein  64 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0449366  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  66.07 
 
 		 175 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  64.46 
 
 		 178 aa  215  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  60 
 
 		 176 aa  214  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0422  appr-1-p processing domain-containing protein  64.46 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  60.74 
 
 		 176 aa  210  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  52.1 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  51.18 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  52.47 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  48.81 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  52.33 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  52.91 
 
 		 177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  50.59 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  50.87 
 
 		 171 aa  161  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  51.74 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  52.12 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  44.97 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  52.44 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  50.89 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  53.62 
 
 		 194 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  49.41 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  51.2 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  49.1 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  49.41 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  48.82 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  51.5 
 
 		 177 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  46.71 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  48.82 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  48.82 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  46.95 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  44.71 
 
 		 176 aa  151  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  49.11 
 
 		 175 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  49.4 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  49.7 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  46.58 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  45.56 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  51.28 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  47.37 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  44.58 
 
 		 168 aa  147  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  43.83 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  47.95 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  49.18 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  48.8 
 
 		 173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  45.98 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  45.25 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  44.91 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  48.75 
 
 		 188 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  47.98 
 
 		 193 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  49.02 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  47.4 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  47.53 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  46.33 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  47.31 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  42.53 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  42.61 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  45.91 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  48.43 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  45.29 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  47.93 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  50.31 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  44.31 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  50.65 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  46.47 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  47.06 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  47.95 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  52.35 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  46.47 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  47.93 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  47.31 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  45.93 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  50.75 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  47.93 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  45.29 
 
 		 174 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  49.34 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  43.68 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  46.33 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  54.84 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  42.44 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  51.47 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  43.82 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  50.74 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  42.24 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  45.09 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  47.2 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0164  Appr-1-p processing domain protein  43.51 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.322732 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  43.68 
 
 		 182 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  41.21 
 
 		 180 aa  130  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  44.25 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>