182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3249 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  77.25 
 
 		 173 aa  258  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  72.73 
 
 		 171 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  69.88 
 
 		 170 aa  236  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  68.75 
 
 		 177 aa  218  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  65.82 
 
 		 175 aa  218  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  65.88 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  63.23 
 
 		 224 aa  211  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  64.07 
 
 		 173 aa  211  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6160  hypothetical protein  63.1 
 
 		 174 aa  204  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506292  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  63.41 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  62.72 
 
 		 171 aa  187  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  56.73 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4618  Appr-1-p processing domain protein  63.41 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  53.37 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3185  appr-1-p processing domain-containing protein  55.09 
 
 		 577 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0073  Appr-1-p processing domain protein  58.67 
 
 		 175 aa  164  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00241191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  48.47 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  50.28 
 
 		 180 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  53.57 
 
 		 175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  49.4 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  52.12 
 
 		 195 aa  157  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3405  Appr-1-p processing domain protein  55.84 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  49.4 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  47.19 
 
 		 180 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  48.26 
 
 		 175 aa  151  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  57.42 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  42.2 
 
 		 190 aa  150  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  45.29 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  49.41 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  48.84 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  47.98 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  46.67 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  47.88 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  50.57 
 
 		 172 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  44.07 
 
 		 179 aa  144  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 		 170 aa  144  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  51.83 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05810  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  54.71 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.198102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  49.11 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  46.88 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  46.67 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  42.35 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  49.69 
 
 		 173 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  48.52 
 
 		 175 aa  141  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  49.1 
 
 		 177 aa  141  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  47.31 
 
 		 181 aa  141  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  42.01 
 
 		 173 aa  140  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  48.8 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  51.85 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  47.37 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  47.37 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000896  hypothetical protein  45.29 
 
 		 170 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  46.11 
 
 		 171 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  49.07 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  53.85 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  44.91 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  44.25 
 
 		 194 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  53.29 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  48.5 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  48.54 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  46.2 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  48.5 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  48.5 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  47.95 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  47.95 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  48.5 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  47.95 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  45.51 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  47.95 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  47.95 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  47.95 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  47.95 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  48.5 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  48.82 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  47.95 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  50.99 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  46.71 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  44.85 
 
 		 173 aa  134  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  47.37 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  50.9 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  49.11 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  50.3 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  49.11 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  49.08 
 
 		 163 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  41.28 
 
 		 167 aa  131  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  44.91 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  51.5 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0422  appr-1-p processing domain-containing protein  46.2 
 
 		 177 aa  131  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  47.1 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  41.21 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  48.08 
 
 		 178 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  45.03 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00650  conserved hypothetical protein  45.4 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  46.45 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  47.16 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  48.78 
 
 		 174 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  46.39 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  46.01 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  51.82 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>