182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0257 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  82.49 
 
 
178 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  81.36 
 
 
178 aa  299  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0694  hypothetical protein  81.92 
 
 
179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000693034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  72.09 
 
 
187 aa  254  5e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0201116 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  60.23 
 
 
177 aa  209  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  60.82 
 
 
220 aa  204  6e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0194  hypothetical protein  59.89 
 
 
189 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.45339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  53.37 
 
 
182 aa  170  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0153  appr-1-p processing domain-containing protein  52.27 
 
 
179 aa  169  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.98 
 
 
599 aa  151  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1415  Appr-1-p processing domain protein  48.88 
 
 
183 aa  150  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  56.39 
 
 
182 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.41 
 
 
599 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  49.44 
 
 
175 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  43.6 
 
 
181 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  56.35 
 
 
184 aa  136  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0998  appr-1-p processing domain-containing protein  45.81 
 
 
175 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  46.43 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  43.02 
 
 
181 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  44.71 
 
 
171 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  40.68 
 
 
180 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  43.26 
 
 
181 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  40 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  45.51 
 
 
175 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  43.37 
 
 
186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  42.94 
 
 
179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  41.18 
 
 
197 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  39.78 
 
 
188 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  42.22 
 
 
181 aa  117  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  45.35 
 
 
184 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  43.43 
 
 
173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  43.2 
 
 
170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  39.41 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  40.7 
 
 
172 aa  111  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  42.31 
 
 
177 aa  111  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  47.02 
 
 
159 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  41.53 
 
 
186 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  38.98 
 
 
190 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0422  appr-1-p processing domain-containing protein  42.29 
 
 
177 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0191366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  41.94 
 
 
224 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  41.92 
 
 
173 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11928  lipoprotein lppD  39.25 
 
 
358 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0395522  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  38.64 
 
 
183 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  45.24 
 
 
177 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  40.72 
 
 
175 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  42.5 
 
 
175 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  39.64 
 
 
175 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  41.67 
 
 
173 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  37.5 
 
 
173 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  44.31 
 
 
185 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  37.35 
 
 
187 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  40.48 
 
 
180 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  48.39 
 
 
171 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0554  Appr-1-p processing domain protein  39.56 
 
 
188 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  38.92 
 
 
179 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  36.99 
 
 
174 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  38.92 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  44.38 
 
 
172 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  40.12 
 
 
177 aa  99  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  38.92 
 
 
179 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  38.92 
 
 
179 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  39.88 
 
 
173 aa  98.6  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  43.35 
 
 
177 aa  98.6  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  41.88 
 
 
174 aa  98.2  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0484  Appr-1-p processing domain protein  38.64 
 
 
202 aa  97.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  37.35 
 
 
175 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  38.32 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  37.29 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  43.03 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0909  appr-1-p processing domain-containing protein  39.33 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0449366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  37.42 
 
 
196 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  40.22 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  37.21 
 
 
175 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  39.1 
 
 
177 aa  94  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2123  Appr-1-p processing  43.9 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  39.1 
 
 
177 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1745  Appr-1-p processing domain protein  38.2 
 
 
179 aa  94.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  39.1 
 
 
177 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  39.1 
 
 
177 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  41.94 
 
 
163 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  39.1 
 
 
177 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  47.9 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  39.1 
 
 
177 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  39.1 
 
 
177 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  39.1 
 
 
177 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  36.05 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  39.1 
 
 
177 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  42.75 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  39.41 
 
 
177 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  35.15 
 
 
183 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  40.96 
 
 
193 aa  90.9  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  35.85 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  36.47 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2073  Appr-1-p processing domain protein  35.47 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  40.24 
 
 
173 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  37.43 
 
 
174 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  37.89 
 
 
171 aa  89.4  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  38.32 
 
 
177 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  40.65 
 
 
177 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>