182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0998 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0998  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 
175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  53.8 
 
 
181 aa  171  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  47.19 
 
 
177 aa  155  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  48.84 
 
 
174 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0194  hypothetical protein  50.29 
 
 
189 aa  151  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.45339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.87 
 
 
599 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.29 
 
 
599 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  42.26 
 
 
173 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  48.59 
 
 
186 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  46.02 
 
 
180 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0153  appr-1-p processing domain-containing protein  51.63 
 
 
179 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  47.4 
 
 
177 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  46.93 
 
 
177 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  42.7 
 
 
182 aa  140  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  44.31 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  48.26 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  45.45 
 
 
177 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  41.76 
 
 
182 aa  137  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  46.15 
 
 
172 aa  136  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  44.38 
 
 
220 aa  135  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  45.51 
 
 
181 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  44.12 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  44.32 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  44.31 
 
 
175 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  45.83 
 
 
181 aa  134  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  44.05 
 
 
177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  44.97 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  43.75 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  45.81 
 
 
196 aa  132  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  42.42 
 
 
176 aa  131  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  41.62 
 
 
177 aa  131  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  41.62 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  41.62 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  41.62 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  41.62 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  41.62 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  41.62 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  41.62 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  40.91 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  44.85 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  41.67 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  41.04 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  42.26 
 
 
177 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  45.56 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  43.21 
 
 
177 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  55.81 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  45.45 
 
 
172 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  43.93 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  41.62 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  43.98 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  40.83 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  43.1 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  42.33 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  43.4 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  40.98 
 
 
190 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  45.45 
 
 
159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  45.06 
 
 
180 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1415  Appr-1-p processing domain protein  42.77 
 
 
183 aa  123  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  38.32 
 
 
194 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  40.24 
 
 
175 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  39.2 
 
 
176 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  43.2 
 
 
193 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  44.91 
 
 
177 aa  121  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  42.86 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  38.82 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  43.83 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  42.95 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  41.04 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  41.04 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  40.59 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  50.74 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  43.03 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  43.21 
 
 
171 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  42.11 
 
 
176 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  43.48 
 
 
171 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  40.46 
 
 
179 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  40.46 
 
 
179 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  41.32 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  43.02 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0422  appr-1-p processing domain-containing protein  40.48 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0191366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  40.46 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  45.06 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  41.76 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  44.51 
 
 
180 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  41.52 
 
 
374 aa  117  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  44.51 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  40.72 
 
 
181 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  39.18 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  42.35 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  42.35 
 
 
171 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  46 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0191  Appr-1-p processing domain protein  42.95 
 
 
341 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  40.57 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  42.51 
 
 
170 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  40.24 
 
 
180 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  39.18 
 
 
179 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000896  hypothetical protein  42.26 
 
 
170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  44.03 
 
 
182 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0554  Appr-1-p processing domain protein  40.12 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  40.49 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>