179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0153 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0153  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1415  Appr-1-p processing domain protein  59.01 
 
 		 183 aa  191  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.96 
 
 		 599 aa  190  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.96 
 
 		 599 aa  190  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  51.14 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  52.27 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  53.94 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0194  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.45339  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  53.49 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  47.4 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  49.43 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  50.3 
 
 		 174 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  58.82 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  51.23 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0694  hypothetical protein  49.43 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000693034 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  46.55 
 
 		 184 aa  147  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  43.82 
 
 		 188 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0998  appr-1-p processing domain-containing protein  51.63 
 
 		 175 aa  144  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  42.44 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  40.45 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  46.9 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  41.03 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  41.03 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  41.03 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  41.03 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  41.03 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  41.03 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  41.03 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  41.03 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  41.03 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  41.42 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  41.92 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  40.61 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  40.61 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  39.29 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  46.41 
 
 		 177 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  42.31 
 
 		 180 aa  127  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  42.42 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  44.17 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  46.63 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  41.67 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  39.52 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  42.6 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  39.29 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  39.87 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  42.41 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0554  Appr-1-p processing domain protein  48.09 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  45.27 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  41.95 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  38.82 
 
 		 197 aa  117  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  36.05 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  43.03 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  45.32 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  43.24 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  43.05 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0191  Appr-1-p processing domain protein  43.97 
 
 		 341 aa  114  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2123  Appr-1-p processing  43.07 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  46.76 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  39.77 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  49.21 
 
 		 166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  38.51 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  36.21 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  41.25 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  47.01 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  37.65 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  42.42 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  44.64 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  45.32 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  38.75 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  39.77 
 
 		 190 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  42.86 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  46.56 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0484  Appr-1-p processing domain protein  37.16 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  43.97 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  42 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  41.84 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  44.23 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  45.32 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  38.12 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  39.26 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  41.84 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  38.51 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  45.45 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  39.63 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  41.72 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  45.93 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  44.6 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  38.32 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  37.35 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  40.88 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  39.35 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  43.48 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  34.3 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  46.83 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  42.54 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6160  hypothetical protein  40.72 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506292  normal  0.273522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>