185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1101 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  69.59 
 
 
177 aa  252  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  60.82 
 
 
196 aa  204  8e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  57.95 
 
 
187 aa  204  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  59.3 
 
 
178 aa  201  8e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0194  hypothetical protein  59.2 
 
 
189 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.45339  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  60.23 
 
 
178 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0694  hypothetical protein  59.64 
 
 
179 aa  189  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000693034 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1415  Appr-1-p processing domain protein  51.53 
 
 
183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0153  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
179 aa  162  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  50.3 
 
 
182 aa  160  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.71 
 
 
599 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.13 
 
 
599 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  48 
 
 
182 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  44.83 
 
 
184 aa  151  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  47.09 
 
 
181 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0998  appr-1-p processing domain-containing protein  44.38 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  47.88 
 
 
171 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  44.31 
 
 
174 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11928  lipoprotein lppD  41.38 
 
 
358 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0395522  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  43.27 
 
 
186 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  45.35 
 
 
173 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  46.11 
 
 
184 aa  121  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  41.62 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  38.82 
 
 
175 aa  118  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  43.45 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  43.11 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3492  Appr-1-p processing domain protein  40.85 
 
 
179 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  40.35 
 
 
175 aa  115  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  44.79 
 
 
176 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  38.38 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  39.18 
 
 
176 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  40.24 
 
 
183 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  37.8 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  40.94 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  46.1 
 
 
174 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  41.25 
 
 
172 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  41.07 
 
 
175 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  42.42 
 
 
166 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  43.45 
 
 
173 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  40.7 
 
 
181 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  43.02 
 
 
183 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  40.13 
 
 
177 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  42.31 
 
 
184 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0422  appr-1-p processing domain-containing protein  37.57 
 
 
177 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0191366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  39.08 
 
 
175 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  37.8 
 
 
224 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  39.64 
 
 
181 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  35.06 
 
 
179 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  36.99 
 
 
187 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  37.57 
 
 
177 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  41.21 
 
 
186 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  37.57 
 
 
177 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  38.95 
 
 
179 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0191  Appr-1-p processing domain protein  39.39 
 
 
341 aa  104  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  37.57 
 
 
177 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  37.57 
 
 
177 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  37.57 
 
 
177 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  40.24 
 
 
175 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  37.57 
 
 
177 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  37.57 
 
 
177 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  38.95 
 
 
179 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  37.57 
 
 
177 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  37.57 
 
 
177 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  38.01 
 
 
175 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  38.37 
 
 
179 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  40.49 
 
 
182 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  37.29 
 
 
179 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  44.17 
 
 
177 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  38.37 
 
 
179 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  38.95 
 
 
179 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  42.94 
 
 
185 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0554  Appr-1-p processing domain protein  37.65 
 
 
188 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  38.82 
 
 
176 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  37.35 
 
 
183 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  36.99 
 
 
172 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  43.2 
 
 
173 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  39.24 
 
 
180 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  34.27 
 
 
199 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  40.13 
 
 
173 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  39.75 
 
 
174 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  37.28 
 
 
176 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  41.07 
 
 
173 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  39.26 
 
 
182 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  42.31 
 
 
159 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  40 
 
 
177 aa  98.6  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2543  AraC family regulator  49.59 
 
 
192 aa  99  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  38.65 
 
 
171 aa  98.6  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000896  hypothetical protein  40.12 
 
 
170 aa  98.6  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  40.37 
 
 
171 aa  98.6  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  44.2 
 
 
164 aa  98.2  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  36.31 
 
 
173 aa  98.2  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  38.27 
 
 
183 aa  98.2  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2073  Appr-1-p processing domain protein  34.59 
 
 
188 aa  98.2  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  39.13 
 
 
173 aa  98.2  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  39.77 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  40 
 
 
177 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  40.61 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  36.84 
 
 
180 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6160  hypothetical protein  40.72 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506292  normal  0.273522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>