177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11928 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11928  lipoprotein lppD  100 
 
 
358 aa  698    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0395522  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  41.38 
 
 
220 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  36.84 
 
 
177 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  41.76 
 
 
187 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  42.61 
 
 
175 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1415  Appr-1-p processing domain protein  38.96 
 
 
183 aa  109  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  39.25 
 
 
196 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  35.06 
 
 
184 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0194  hypothetical protein  39.52 
 
 
189 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.45339  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  39.53 
 
 
178 aa  106  8e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3492  Appr-1-p processing domain protein  41.36 
 
 
179 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  38.69 
 
 
178 aa  103  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  35.06 
 
 
182 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0694  hypothetical protein  40.96 
 
 
179 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000693034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1745  Appr-1-p processing domain protein  40.38 
 
 
179 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  40.24 
 
 
197 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  42.36 
 
 
176 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  38.69 
 
 
173 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  37.42 
 
 
159 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  33.14 
 
 
182 aa  96.7  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  34.76 
 
 
181 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  38.37 
 
 
171 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  40.8 
 
 
173 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.8 
 
 
599 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  34.13 
 
 
176 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  40.29 
 
 
196 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.23 
 
 
599 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  37.29 
 
 
175 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  38.69 
 
 
181 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  39.62 
 
 
174 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  37.8 
 
 
182 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  39.47 
 
 
184 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  41.22 
 
 
183 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  32.02 
 
 
176 aa  89.7  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0422  appr-1-p processing domain-containing protein  34.83 
 
 
177 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0191366 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  36.9 
 
 
168 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  35.4 
 
 
173 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0998  appr-1-p processing domain-containing protein  33.9 
 
 
175 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0071  hypothetical protein  39.55 
 
 
177 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2073  Appr-1-p processing domain protein  37.04 
 
 
188 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  38.24 
 
 
179 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  39.73 
 
 
175 aa  86.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  36.59 
 
 
182 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0153  appr-1-p processing domain-containing protein  36.09 
 
 
179 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  32.14 
 
 
174 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  32.12 
 
 
173 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  41.09 
 
 
178 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  37.2 
 
 
177 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  40.97 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  36.26 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  40.97 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  37.2 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  33.13 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3185  appr-1-p processing domain-containing protein  38.76 
 
 
577 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35791  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  41.89 
 
 
193 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  33.93 
 
 
170 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  36.36 
 
 
184 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  31.4 
 
 
175 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  34.38 
 
 
175 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  34.52 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0073  Appr-1-p processing domain protein  38.51 
 
 
175 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00241191  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  39.6 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  31.52 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  35 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  32.08 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  33.33 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  36.84 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0191  Appr-1-p processing domain protein  41.86 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  36.36 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  36.49 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  36.05 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  37.58 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  37.97 
 
 
177 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  29.55 
 
 
180 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  37.58 
 
 
174 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  37.97 
 
 
177 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  37.97 
 
 
177 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  35.37 
 
 
181 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4618  Appr-1-p processing domain protein  38.92 
 
 
170 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  35.62 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  37.97 
 
 
188 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  34.29 
 
 
186 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  37.35 
 
 
173 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  37.89 
 
 
173 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  38.01 
 
 
171 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  37.97 
 
 
177 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  37.97 
 
 
188 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  32 
 
 
181 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6160  hypothetical protein  36.57 
 
 
174 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506292  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  38.26 
 
 
174 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  34.76 
 
 
177 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  36.84 
 
 
175 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  40.97 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05810  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  46.46 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.198102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  36.24 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  35.71 
 
 
180 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0909  appr-1-p processing domain-containing protein  36.84 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0449366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  34.36 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  35.29 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>