70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1575 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  100 
 
 		 2967 bp  3729    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  90.32 
 
 		 2895 bp  2286    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  84.1 
 
 		 2973 bp  1354    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  84.1 
 
 		 2973 bp  1354    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  84.1 
 
 		 2973 bp  1354    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  82.91 
 
 		 2967 bp  759    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  82.91 
 
 		 2967 bp  759    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  83.94 
 
 		 2973 bp  1330    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1297    91.51 
 
 		 1016 bp  678    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  84.6 
 
 		 2973 bp  1402    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  83.7 
 
 		 2967 bp  823    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  84.17 
 
 		 2973 bp  1334    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  82.03 
 
 		 2967 bp  1011    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  87.11 
 
 		 933 bp  648    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0157    83.72 
 
 		 1755 bp  825    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336177  normal  0.717019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  83.49 
 
 		 2967 bp  848    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  83.7 
 
 		 1821 bp  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  84.6 
 
 		 2973 bp  1402    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  90.32 
 
 		 2967 bp  2286    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  92.82 
 
 		 2967 bp  2658    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  90.91 
 
 		 2967 bp  2373    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1575    100 
 
 		 1881 bp  3729    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  91.44 
 
 		 2967 bp  2452    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  91.51 
 
 		 1020 bp  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  82.03 
 
 		 2967 bp  1011    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  82.25 
 
 		 2970 bp  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2295    84.37 
 
 		 1066 bp  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  92.77 
 
 		 2967 bp  2650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6002    100 
 
 		 675 bp  1338    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  100 
 
 		 2967 bp  3729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  91.24 
 
 		 2970 bp  2422    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  84.23 
 
 		 2268 bp  1342    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  100 
 
 		 2967 bp  3729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  100 
 
 		 2967 bp  3729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3476    89.14 
 
 		 2978 bp  2050    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  90.95 
 
 		 795 bp  628  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  88.09 
 
 		 768 bp  618  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  90.95 
 
 		 486 bp  615  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2143    90.77 
 
 		 444 bp  555  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  89.25 
 
 		 612 bp  452  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1409    90.66 
 
 		 765 bp  412  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15410    100 
 
 		 201 bp  398  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  9.49822e-18  unclonable  4.892999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  84.22 
 
 		 1581 bp  329  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1120    87.17 
 
 		 811 bp  323  1e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  86.42 
 
 		 3048 bp  274  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1040    84.68 
 
 		 1318 bp  272  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1488  hypothetical protein  94.21 
 
 		 168 bp  184  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0200539  normal  0.398384 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0916  hypothetical protein  87.43 
 
 		 336 bp  172  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1331  hypothetical protein  92.38 
 
 		 144 bp  137  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  82.14 
 
 		 2967 bp  127  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  82.14 
 
 		 2967 bp  127  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  82.14 
 
 		 2967 bp  127  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  83.33 
 
 		 2958 bp  115  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1039  hypothetical protein  92.31 
 
 		 93 bp  89.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0914  hypothetical protein  84.38 
 
 		 162 bp  71.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  86.49 
 
 		 675 bp  67.9  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  93.33 
 
 		 2979 bp  65.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  93.33 
 
 		 2979 bp  65.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  87.3 
 
 		 822 bp  61.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15420    100 
 
 		 165 bp  60  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.98117e-18  unclonable  4.51223e-22 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2055  hypothetical protein  93.33 
 
 		 132 bp  58  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  94.29 
 
 		 2319 bp  54  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8509    85.71 
 
 		 1405 bp  54  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577917  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  86.21 
 
 		 2952 bp  52  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3844  hypothetical protein  87.04 
 
 		 495 bp  52  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  93.94 
 
 		 1641 bp  50.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  93.94 
 
 		 2886 bp  50.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  83.82 
 
 		 2196 bp  48.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  91.67 
 
 		 2976 bp  48.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  91.67 
 
 		 2976 bp  48.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>