70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1297 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  91.31 
 
 		 2967 bp  670    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  91.12 
 
 		 2895 bp  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  90.93 
 
 		 2967 bp  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  93.44 
 
 		 2967 bp  757    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  93.02 
 
 		 2967 bp  737    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1297    100 
 
 		 1016 bp  2014    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  91.51 
 
 		 2967 bp  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  91.51 
 
 		 2967 bp  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  100 
 
 		 1020 bp  2014    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  90.7 
 
 		 2970 bp  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  91.51 
 
 		 2967 bp  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6002    91.51 
 
 		 675 bp  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  91.31 
 
 		 2967 bp  670    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1575    91.51 
 
 		 1881 bp  678    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  91.51 
 
 		 2967 bp  678    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  90.54 
 
 		 795 bp  613  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  90.53 
 
 		 486 bp  599  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3476    90.41 
 
 		 2978 bp  573  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2143    89.86 
 
 		 444 bp  523  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  87.07 
 
 		 2973 bp  496  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  87.07 
 
 		 2973 bp  496  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  86.82 
 
 		 2973 bp  484  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  86.82 
 
 		 2973 bp  484  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  86.82 
 
 		 2973 bp  484  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  86.82 
 
 		 2268 bp  484  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  86.82 
 
 		 2973 bp  484  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  86.63 
 
 		 2973 bp  476  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  85.56 
 
 		 2967 bp  383  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  85.56 
 
 		 1821 bp  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  85.56 
 
 		 768 bp  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  85.56 
 
 		 612 bp  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  85.56 
 
 		 933 bp  383  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  88.52 
 
 		 1581 bp  385  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1409    89.46 
 
 		 765 bp  381  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0157    88.76 
 
 		 1755 bp  379  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336177  normal  0.717019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  84.9 
 
 		 2967 bp  359  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  87.46 
 
 		 2967 bp  339  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  87.46 
 
 		 2967 bp  339  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2295    86.73 
 
 		 1066 bp  331  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  83.44 
 
 		 2970 bp  307  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  86.75 
 
 		 3048 bp  281  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  81.67 
 
 		 2967 bp  266  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  81.67 
 
 		 2967 bp  266  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15410    91.04 
 
 		 201 bp  256  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  9.49822e-18  unclonable  4.892999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1488  hypothetical protein  95.04 
 
 		 168 bp  192  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0200539  normal  0.398384 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1040    90.91 
 
 		 1318 bp  167  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0917    92.31 
 
 		 608 bp  125  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1120    89.11 
 
 		 811 bp  113  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  85.25 
 
 		 2958 bp  99.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  85.25 
 
 		 2967 bp  99.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  85.25 
 
 		 2967 bp  99.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  85.25 
 
 		 2967 bp  99.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1331  hypothetical protein  94.92 
 
 		 144 bp  85.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1039  hypothetical protein  90.14 
 
 		 93 bp  85.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0914  hypothetical protein  85.42 
 
 		 162 bp  79.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  100 
 
 		 381 bp  61.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  100 
 
 		 381 bp  61.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  100 
 
 		 381 bp  61.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  85.92 
 
 		 2991 bp  61.9  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2055  hypothetical protein  93.33 
 
 		 132 bp  58  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  88.46 
 
 		 675 bp  56  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1102    84.51 
 
 		 6388 bp  54  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  84.51 
 
 		 2991 bp  54  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  84.51 
 
 		 2991 bp  54  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  84.51 
 
 		 2991 bp  54  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3844  hypothetical protein  87.04 
 
 		 495 bp  52  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  86.21 
 
 		 2952 bp  52  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  86.54 
 
 		 2985 bp  48.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  93.75 
 
 		 1722 bp  48.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 3888 bp  48.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>