50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2295 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  84.37 
 
 		 2967 bp  654    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1575    84.37 
 
 		 1881 bp  654    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2295    100 
 
 		 1066 bp  2113    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  84.48 
 
 		 2967 bp  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  84.6 
 
 		 2967 bp  670    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  84.48 
 
 		 2895 bp  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  84.37 
 
 		 2967 bp  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  84.25 
 
 		 2967 bp  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  84.37 
 
 		 2967 bp  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  84.37 
 
 		 2967 bp  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  83.79 
 
 		 2967 bp  615  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  83.56 
 
 		 2967 bp  599  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  82.09 
 
 		 2970 bp  494  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3476    81.86 
 
 		 2978 bp  478  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6002    84.57 
 
 		 675 bp  394  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  81.02 
 
 		 2967 bp  389  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  80.95 
 
 		 2967 bp  345  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  80.95 
 
 		 1821 bp  345  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0157    80.95 
 
 		 1755 bp  345  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336177  normal  0.717019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  79.84 
 
 		 2268 bp  339  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  79.84 
 
 		 2973 bp  339  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  79.84 
 
 		 2973 bp  339  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  79.84 
 
 		 2973 bp  339  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  79.84 
 
 		 2973 bp  339  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  86.73 
 
 		 1020 bp  331  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1297    86.73 
 
 		 1016 bp  331  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  79.73 
 
 		 2973 bp  331  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  79.38 
 
 		 2973 bp  307  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  79.38 
 
 		 2973 bp  307  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  80.33 
 
 		 933 bp  293  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  87.54 
 
 		 2967 bp  272  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  87.54 
 
 		 2967 bp  272  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  79.69 
 
 		 768 bp  224  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  82.97 
 
 		 795 bp  220  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  82.89 
 
 		 486 bp  206  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2143    85.86 
 
 		 444 bp  170  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1409    88.39 
 
 		 765 bp  165  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  79.12 
 
 		 612 bp  143  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  81.32 
 
 		 3048 bp  129  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  78.44 
 
 		 2967 bp  115  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  78.44 
 
 		 2967 bp  115  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1331  hypothetical protein  91.36 
 
 		 144 bp  97.6  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  81.13 
 
 		 2967 bp  95.6  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  81.13 
 
 		 2967 bp  95.6  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  81.13 
 
 		 2967 bp  95.6  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15410    87.04 
 
 		 201 bp  95.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  9.49822e-18  unclonable  4.892999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1488  hypothetical protein  89.61 
 
 		 168 bp  89.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0200539  normal  0.398384 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  79.56 
 
 		 2970 bp  73.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3844  hypothetical protein  83.82 
 
 		 495 bp  48.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  83.82 
 
 		 822 bp  48.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>