58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0157 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  100 
 
 		 768 bp  1181    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  83.72 
 
 		 2967 bp  825    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  100 
 
 		 933 bp  1364    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0157    100 
 
 		 1755 bp  3479    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336177  normal  0.717019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  100 
 
 		 2967 bp  3134    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  96.13 
 
 		 2967 bp  2642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  100 
 
 		 612 bp  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  99.94 
 
 		 1821 bp  3261    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  92.71 
 
 		 2967 bp  2216    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  92.71 
 
 		 2967 bp  2216    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  83.32 
 
 		 2895 bp  751    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  83.32 
 
 		 2967 bp  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  82.86 
 
 		 2967 bp  846    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  82.31 
 
 		 2967 bp  656    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  83.72 
 
 		 2967 bp  825    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  83.72 
 
 		 2967 bp  825    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  83.39 
 
 		 2967 bp  753    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1575    83.72 
 
 		 1881 bp  825    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  81.97 
 
 		 2967 bp  809    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  83.72 
 
 		 2967 bp  825    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6002    86.71 
 
 		 675 bp  468  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3476    89.04 
 
 		 2978 bp  406  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  81.63 
 
 		 2970 bp  391  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  88.76 
 
 		 1020 bp  379  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1297    88.76 
 
 		 1016 bp  379  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  89.2 
 
 		 795 bp  365  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  89.51 
 
 		 486 bp  351  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  87.36 
 
 		 2268 bp  349  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  87.36 
 
 		 2973 bp  349  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  87.36 
 
 		 2973 bp  349  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  87.36 
 
 		 2973 bp  349  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  87.36 
 
 		 2973 bp  349  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2295    80.95 
 
 		 1066 bp  345  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  87.08 
 
 		 2973 bp  341  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  86.16 
 
 		 2973 bp  339  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  86.16 
 
 		 2973 bp  339  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2143    89.96 
 
 		 444 bp  319  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  83.96 
 
 		 3048 bp  226  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  82.17 
 
 		 2970 bp  204  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  78.98 
 
 		 2967 bp  182  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  78.98 
 
 		 2967 bp  182  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1409    86.62 
 
 		 765 bp  145  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  80.52 
 
 		 2967 bp  117  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  80.52 
 
 		 2967 bp  117  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  80.52 
 
 		 2967 bp  117  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  77.54 
 
 		 2958 bp  103  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1120    89.41 
 
 		 811 bp  97.6  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1039  hypothetical protein  90.16 
 
 		 93 bp  73.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  82.64 
 
 		 1581 bp  73.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1331  hypothetical protein  84.62 
 
 		 144 bp  71.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  82.76 
 
 		 822 bp  71.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  97.3 
 
 		 1641 bp  65.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  97.3 
 
 		 2886 bp  65.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2055  hypothetical protein  96.88 
 
 		 132 bp  56  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  96.77 
 
 		 2319 bp  54  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  89.13 
 
 		 2952 bp  52  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1040    82.35 
 
 		 1318 bp  50.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  80 
 
 		 2196 bp  48.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>