50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1120 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1040    98.25 
 
 		 1318 bp  844    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1120    100 
 
 		 811 bp  1608    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  87.28 
 
 		 2967 bp  329  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1575    87.17 
 
 		 1881 bp  323  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  87.17 
 
 		 2967 bp  323  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  87.17 
 
 		 2967 bp  323  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  87.17 
 
 		 2967 bp  323  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  87.17 
 
 		 2967 bp  323  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  86.71 
 
 		 2967 bp  313  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  84.71 
 
 		 2970 bp  254  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  83.82 
 
 		 2967 bp  234  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  83.57 
 
 		 2967 bp  228  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3476    83.18 
 
 		 2978 bp  208  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0914  hypothetical protein  89.02 
 
 		 162 bp  204  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 93 bp  184  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0916  hypothetical protein  100 
 
 		 336 bp  161  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  80.88 
 
 		 2967 bp  151  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  80.59 
 
 		 2895 bp  143  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  81.4 
 
 		 2973 bp  123  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  81.4 
 
 		 2973 bp  123  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  89.8 
 
 		 2973 bp  115  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  89.8 
 
 		 2268 bp  115  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  89.8 
 
 		 2973 bp  115  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  89.8 
 
 		 2973 bp  115  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  89.8 
 
 		 2973 bp  115  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1297    89.11 
 
 		 1016 bp  113  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  89.11 
 
 		 1020 bp  113  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  88.78 
 
 		 795 bp  107  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  88.78 
 
 		 2967 bp  107  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  88.78 
 
 		 2967 bp  107  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  88.78 
 
 		 2973 bp  107  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6002    89.89 
 
 		 675 bp  105  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  87.76 
 
 		 486 bp  99.6  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0157    89.41 
 
 		 1755 bp  97.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336177  normal  0.717019 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  89.41 
 
 		 933 bp  97.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15410    87.63 
 
 		 201 bp  97.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  9.49822e-18  unclonable  4.892999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  89.41 
 
 		 2967 bp  97.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1409    87.63 
 
 		 765 bp  97.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  89.41 
 
 		 768 bp  97.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  89.41 
 
 		 612 bp  97.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  89.41 
 
 		 1821 bp  97.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  86.73 
 
 		 2967 bp  91.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1488  hypothetical protein  87.1 
 
 		 168 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0200539  normal  0.398384 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  80.66 
 
 		 2967 bp  81.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2143    85.57 
 
 		 444 bp  81.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  80.66 
 
 		 2967 bp  81.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  89.29 
 
 		 3048 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  97.14 
 
 		 1581 bp  61.9  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  92.11 
 
 		 2970 bp  52  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2055  hypothetical protein  96.55 
 
 		 132 bp  50.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>