52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15410 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1575    100 
 
 		 1881 bp  398  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15410    100 
 
 		 201 bp  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  9.49822e-18  unclonable  4.892999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6002    100 
 
 		 675 bp  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  100 
 
 		 2967 bp  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  100 
 
 		 2967 bp  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  100 
 
 		 2967 bp  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  100 
 
 		 2967 bp  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  95.38 
 
 		 2970 bp  315  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  92.82 
 
 		 2967 bp  276  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1409    91.54 
 
 		 765 bp  264  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  91.54 
 
 		 486 bp  264  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  91.46 
 
 		 795 bp  260  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  91.04 
 
 		 1020 bp  256  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1297    91.04 
 
 		 1016 bp  256  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  90.55 
 
 		 2967 bp  248  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  90.77 
 
 		 2967 bp  244  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  89.85 
 
 		 2895 bp  232  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2143    89.85 
 
 		 444 bp  232  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  89.34 
 
 		 2967 bp  224  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  88.06 
 
 		 2967 bp  208  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1488  hypothetical protein  94.21 
 
 		 168 bp  184  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0200539  normal  0.398384 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  88.8 
 
 		 2973 bp  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  88.8 
 
 		 2973 bp  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3476    86.49 
 
 		 2978 bp  135  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  87.72 
 
 		 2973 bp  115  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  87.72 
 
 		 2973 bp  115  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  87.72 
 
 		 2973 bp  115  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  87.72 
 
 		 2973 bp  115  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  87.72 
 
 		 2268 bp  115  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  87.72 
 
 		 2973 bp  115  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  82.12 
 
 		 2967 bp  101  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  82.12 
 
 		 2967 bp  101  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1120    87.63 
 
 		 811 bp  97.6  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2295    87.04 
 
 		 1066 bp  95.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  90.28 
 
 		 2970 bp  87.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  94.44 
 
 		 2967 bp  83.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  92.59 
 
 		 2967 bp  75.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  92.59 
 
 		 933 bp  75.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  92.59 
 
 		 612 bp  75.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  92.59 
 
 		 1821 bp  75.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  92.59 
 
 		 768 bp  75.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  90.16 
 
 		 2967 bp  73.8  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  90.16 
 
 		 2967 bp  73.8  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0914  hypothetical protein  84.38 
 
 		 162 bp  71.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  93.33 
 
 		 2979 bp  65.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  93.33 
 
 		 2979 bp  65.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3844  hypothetical protein  87.04 
 
 		 495 bp  52  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  91.67 
 
 		 2976 bp  48.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  91.67 
 
 		 2976 bp  48.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  91.43 
 
 		 1641 bp  46.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  91.43 
 
 		 2886 bp  46.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  91.43 
 
 		 339 bp  46.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.914851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>