29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15420 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_15420    100 
 
 		 165 bp  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.98117e-18  unclonable  4.51223e-22 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  100 
 
 		 2967 bp  272  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  100 
 
 		 2967 bp  272  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  100 
 
 		 2967 bp  272  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  100 
 
 		 2967 bp  272  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  96.35 
 
 		 2967 bp  232  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1409    94.53 
 
 		 765 bp  198  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  91.6 
 
 		 2970 bp  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  90.08 
 
 		 2967 bp  157  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  90.08 
 
 		 2967 bp  157  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  89.55 
 
 		 2967 bp  155  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  89.31 
 
 		 2895 bp  149  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  84.09 
 
 		 2973 bp  95.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  84.09 
 
 		 2973 bp  95.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  83.33 
 
 		 2973 bp  87.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  82.58 
 
 		 2973 bp  79.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  82.58 
 
 		 2973 bp  79.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  82.58 
 
 		 2973 bp  79.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  82.58 
 
 		 2973 bp  79.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  83.33 
 
 		 1581 bp  79.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  85.88 
 
 		 2967 bp  73.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3476    81.68 
 
 		 2978 bp  69.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  83.67 
 
 		 2970 bp  67.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4124  transposase Tn3  81.9 
 
 		 309 bp  63.9  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632177 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6002    100 
 
 		 675 bp  60  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1575    100 
 
 		 1881 bp  60  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  80.67 
 
 		 2967 bp  54  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  80.67 
 
 		 2967 bp  54  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  96.43 
 
 		 2268 bp  48.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>