More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1601 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1601  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  100 
 
 
393 aa  819    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  27.82 
 
 
388 aa  132  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  27.56 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  28.79 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  28.19 
 
 
382 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  27.71 
 
 
384 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  29.79 
 
 
388 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  31.67 
 
 
393 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  28.8 
 
 
390 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5540  putative acetyl-CoA C-acyltransferase  28.49 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  26.8 
 
 
391 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  28.08 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  27.86 
 
 
395 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  27.23 
 
 
388 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  30.08 
 
 
385 aa  113  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  27.82 
 
 
389 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  27.39 
 
 
382 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  29.4 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  28.35 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  27.78 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  26.95 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  31.3 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  27.68 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  27.66 
 
 
382 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  27.69 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  28.39 
 
 
402 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  27.82 
 
 
385 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  28.39 
 
 
403 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  26.58 
 
 
383 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  28.61 
 
 
388 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  27.39 
 
 
382 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  24.03 
 
 
389 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  30.08 
 
 
382 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  26.51 
 
 
383 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  25.69 
 
 
383 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  26.58 
 
 
404 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  28.19 
 
 
384 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  26.77 
 
 
390 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  28.97 
 
 
383 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  26.12 
 
 
390 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  24.75 
 
 
403 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  28.33 
 
 
402 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  27.79 
 
 
387 aa  103  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  29.06 
 
 
388 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  26.12 
 
 
404 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  27.18 
 
 
381 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3601  hypothetical protein  28.08 
 
 
397 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450403  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  28.72 
 
 
379 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  27.02 
 
 
388 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  27.71 
 
 
381 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  27.02 
 
 
388 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  27.02 
 
 
388 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  27.63 
 
 
391 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  24.56 
 
 
388 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  27.95 
 
 
387 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  27.88 
 
 
379 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  28.19 
 
 
380 aa  100  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  24.62 
 
 
387 aa  99.4  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  24.46 
 
 
378 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  25.19 
 
 
387 aa  99  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  27.85 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  25 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  25.2 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  26.77 
 
 
384 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  26.72 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  25.51 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  26.39 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7490  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  26.15 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.51 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.32 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  25.34 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  25.93 
 
 
407 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  24.56 
 
 
389 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  26.37 
 
 
460 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.38 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  25.63 
 
 
395 aa  93.2  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  24.11 
 
 
386 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.13 
 
 
392 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  25.43 
 
 
387 aa  93.2  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  27.46 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  23.92 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  25.96 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  23.65 
 
 
392 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  27.42 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  25.33 
 
 
388 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  24.94 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3981  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.39 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.480226  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  23.65 
 
 
392 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  26.69 
 
 
389 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  25.9 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  25.61 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  24.21 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  24.38 
 
 
413 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  24.38 
 
 
413 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  22.72 
 
 
390 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3966  propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.59 
 
 
392 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.238561  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  25 
 
 
386 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  29.32 
 
 
394 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  26.38 
 
 
383 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.13 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>