57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1409 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  294  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  36.91 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  36.91 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  34.39 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  35.14 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  39.29 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  37.67 
 
 		 190 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  34.39 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  36.18 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  29.69 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  38.51 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  38.04 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  31.69 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  30.07 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  31.14 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  32.41 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  29.8 
 
 		 189 aa  50.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  32.88 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  32 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  30.95 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  32 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  29.63 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2543  hypothetical protein  31.67 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.603561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  29.1 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  29.76 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0197  hypothetical protein  27.1 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  25.97 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  25.97 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  25.97 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  30.4 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  34.04 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2480  hypothetical protein  34.09 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2048  hypothetical protein  25.53 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0224363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2908  hypothetical protein  34.09 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00873066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3216  hypothetical protein  34.48 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0618648  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  32.53 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2525  hypothetical protein  25.53 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3064  hypothetical protein  31.71 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3200  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0643928  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  31.11 
 
 		 168 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  28.03 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6250  hypothetical protein  32.1 
 
 		 193 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3867  hypothetical protein  35.71 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2881  hypothetical protein  27.46 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  0.292612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0016  hypothetical protein  37.5 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4125  hypothetical protein  32.1 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1923  hypothetical protein  32.1 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2137  hypothetical protein  32.1 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000987674  hitchhiker  0.00718349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1384  hypothetical protein  32 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1628  hypothetical protein  32.93 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511359  normal  0.669453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.603459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  29.08 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0875  hypothetical protein  29.63 
 
 		 197 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.437041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>