38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1738 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  75.64 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  64.24 
 
 
190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  61.64 
 
 
161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  60.38 
 
 
164 aa  175  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  58.28 
 
 
173 aa  167  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  51.59 
 
 
176 aa  151  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  50.34 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  127  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  39.1 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  34.39 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  37.78 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  35.43 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0197  hypothetical protein  34.51 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  33.12 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  32.7 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  33.54 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  38.41 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  27.95 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  31.1 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  41.46 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  32.12 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  29.8 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  34.87 
 
 
186 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3200  hypothetical protein  29.25 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0643928  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  39.02 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  38.36 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  38.36 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  38.36 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  31.21 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  29.27 
 
 
172 aa  48.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  31.87 
 
 
168 aa  47.8  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  36.99 
 
 
167 aa  47  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  26.29 
 
 
189 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  31.01 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  29.1 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  26.25 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>