36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2648 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  60.53 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  54.91 
 
 		 190 aa  173  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  58.28 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  56.86 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  55.92 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  55.56 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  52.2 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  55.7 
 
 		 162 aa  141  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  34.93 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  36.05 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0197  hypothetical protein  35.44 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  85.1  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  35.71 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  40.4 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  33.53 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  35.43 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  30.19 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  30.97 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  31.41 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  30.73 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  30.32 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  30.43 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  36.17 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  32.53 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  32.38 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  27.01 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  28.89 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  38.81 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  38.81 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  38.81 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0643928  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  30.4 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  26.12 
 
 		 173 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  31.18 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>