24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12280 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  100 
 
 		 170 aa  334  3.9999999999999995e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  37.09 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  32.16 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  38.71 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  40.67 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  46.81 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  39.1 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  33.11 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  34.93 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  39.85 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0197  hypothetical protein  34.68 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  38.04 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  34.48 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  30.6 
 
 		 232 aa  51.6  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  28.1 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  31.45 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  31.45 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  30.43 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  31.45 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  32.21 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  41.79 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  31.46 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  30.39 
 
 		 183 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  31.68 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>