36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1520 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  351  4e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  66.67 
 
 
190 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  64.52 
 
 
164 aa  190  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  61.49 
 
 
161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  56.13 
 
 
156 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  51.59 
 
 
162 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  53.59 
 
 
173 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  52.32 
 
 
162 aa  131  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  44.55 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  34.39 
 
 
151 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0197  hypothetical protein  33.12 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  35.16 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  32.54 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  30.07 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  27.91 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  29.68 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  30.32 
 
 
232 aa  62.4  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  31.79 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3200  hypothetical protein  32.72 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0643928  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  34.4 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  35.14 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  29.7 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  35.56 
 
 
168 aa  54.3  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  35.05 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  34.44 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  34.44 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  34.44 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  30.95 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  29.35 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  29.27 
 
 
167 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  42.62 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  39.44 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  28.22 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  26.72 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  30.48 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>