34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0528 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  100 
 
 		 168 aa  329  9e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  82.14 
 
 		 168 aa  275  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  82.14 
 
 		 168 aa  275  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  82.14 
 
 		 168 aa  275  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  70.66 
 
 		 169 aa  242  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  64.88 
 
 		 168 aa  216  7.999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  62.28 
 
 		 167 aa  208  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  53.89 
 
 		 172 aa  170  7.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  57.23 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  50.61 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  46.75 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  50.61 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  48.78 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  37.95 
 
 		 189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  34.32 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  32.9 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  35.58 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  31.33 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  27.91 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  31.79 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  40.59 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  26.8 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  33.92 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  30.43 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  29.1 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3411  hypothetical protein  29.6 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  30.63 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  35.56 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  44.9 
 
 		 158 aa  44.3  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  32.08 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  33.7 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  38.57 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>