24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1343 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  50.69 
 
 
180 aa  142  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  35.06 
 
 
189 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  31.72 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  32.31 
 
 
169 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  31.33 
 
 
183 aa  73.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  26.8 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  29.45 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  32.89 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  27.74 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  29.71 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  29.1 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  26.21 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  25.49 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  26.21 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  26.21 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  30.07 
 
 
166 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  27.63 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  23.65 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  31.5 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  29.37 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  34.74 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  28.42 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>