35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0318 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  329  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  60.61 
 
 
167 aa  204  7e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  58.82 
 
 
172 aa  189  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  56.8 
 
 
169 aa  188  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  59.04 
 
 
168 aa  186  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  57.49 
 
 
168 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  57.49 
 
 
168 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  57.49 
 
 
168 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  57.23 
 
 
168 aa  176  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  54.27 
 
 
185 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  50.9 
 
 
183 aa  159  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  54.88 
 
 
185 aa  158  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  53.05 
 
 
185 aa  156  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  43.79 
 
 
189 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  37.82 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  38.92 
 
 
189 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  35.71 
 
 
186 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  34.78 
 
 
167 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  36.65 
 
 
166 aa  97.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  35.98 
 
 
164 aa  89  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  29.82 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  42.94 
 
 
187 aa  84.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  33.55 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  36.36 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  30.77 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  31.29 
 
 
232 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  28.89 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  30.23 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  30.84 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  29.91 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  32.54 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5214  hypothetical protein  27.13 
 
 
162 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000310717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60530  hypothetical protein  27.13 
 
 
162 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012244  normal  0.488728 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0436  hypothetical protein  26.76 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00784425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3411  hypothetical protein  26.56 
 
 
165 aa  41.2  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>