40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0455 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  323  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  81.21 
 
 		 165 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  79.39 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  72.12 
 
 		 166 aa  243  9e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  44.72 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  40.37 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  31.25 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  35.37 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  35 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  35.84 
 
 		 185 aa  87.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  34.3 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  32.72 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  36.02 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  34.3 
 
 		 185 aa  85.5  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  31.33 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  31.51 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  31.51 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  31.51 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  33.54 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  28.74 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  31.14 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  28.92 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  33.91 
 
 		 190 aa  51.2  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  36.94 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  36.26 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  33.63 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  32.37 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  33.62 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  34.74 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  29.63 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  28.47 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  30.46 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  31.58 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3851  hypothetical protein  27.46 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3668  hypothetical protein  27.46 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3725  hypothetical protein  27.46 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0780  hypothetical protein  27.61 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>