36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3134 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  322  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  73.94 
 
 		 165 aa  247  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  72.12 
 
 		 167 aa  243  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  72.39 
 
 		 186 aa  229  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  51.2 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  42.5 
 
 		 189 aa  110  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  41.14 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  37.41 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  34.62 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  32.9 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  32.05 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  32.05 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  33.95 
 
 		 185 aa  88.2  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  32.05 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  87.8  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  32.92 
 
 		 172 aa  87  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  34.78 
 
 		 168 aa  84.3  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  34.15 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  29.81 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  36.97 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  32.73 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  30.07 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  32.2 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  29.94 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  33.04 
 
 		 176 aa  50.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  32.88 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  33.91 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  33.04 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  33.93 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  29.3 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  29.57 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  28.48 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  28.46 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>