30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1457 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  332  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  70.66 
 
 
168 aa  242  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  68.86 
 
 
168 aa  238  4e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  68.86 
 
 
168 aa  238  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  68.86 
 
 
168 aa  238  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  65.87 
 
 
168 aa  224  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  65.66 
 
 
167 aa  223  7e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  54.07 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  56.8 
 
 
169 aa  165  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  50.3 
 
 
185 aa  151  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  49.7 
 
 
185 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  47.88 
 
 
185 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  43.79 
 
 
183 aa  135  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  40.24 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  34.38 
 
 
165 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  35.71 
 
 
189 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  31.25 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  34.62 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  31.82 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  34.15 
 
 
164 aa  84.7  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  42.17 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  27.49 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  32.9 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  23.65 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  28.1 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  39.02 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  23.45 
 
 
232 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  28.95 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  40.8  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>