37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0411 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  44.19 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  40.24 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  39.08 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  37.93 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  37.7 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  44.1 
 
 		 165 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  44.72 
 
 		 167 aa  121  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  40.34 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  43.79 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  41.24 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  37.95 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  42.5 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  38.55 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  38.55 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  38.55 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  38.55 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  37.58 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  36.75 
 
 		 167 aa  104  9e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  38.92 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  32.89 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  33.54 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  30.56 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  30.92 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  29.19 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  33.74 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  35.9 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  29.8 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  28.48 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  32.91 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  32.41 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  29.11 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0643928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  31.58 
 
 		 164 aa  42  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  30.12 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>