37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3213 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  40.4 
 
 		 173 aa  85.1  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  40.4 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  38.41 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  37.61 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  30.57 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  34.93 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  33.99 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  32.21 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  31.29 
 
 		 162 aa  62  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0197  hypothetical protein  31.37 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  28.86 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  29.29 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  28.19 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  28.19 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  28.71 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  31.36 
 
 		 167 aa  52.4  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  27.91 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  27.81 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  36.26 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  36.26 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  31.93 
 
 		 168 aa  48.5  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1525  hypothetical protein  29.36 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00081824  normal  0.11672 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  29.49 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  29.89 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  25.32 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  22.22 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  26.98 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  28.12 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  28.12 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  28.12 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  29.51 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  29.25 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>