31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0008 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  363  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  38 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  35.26 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  33.95 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  38.19 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  43.3 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  35.81 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  33.13 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  34.15 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  34.11 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  34.51 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0197  hypothetical protein  29.79 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  29.28 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  30.14 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  30.14 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  31.47 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  28.77 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  31.82 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  29.61 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  27.89 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  29.66 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  29.17 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  29.57 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  35 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  27.5 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  28.46 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  28.28 
 
 		 173 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  28.76 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>