40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0160 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  362  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  95.14 
 
 
185 aa  348  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  94.05 
 
 
185 aa  345  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  50.3 
 
 
172 aa  156  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  47.88 
 
 
169 aa  149  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  50.31 
 
 
167 aa  145  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  48.78 
 
 
168 aa  142  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  47.56 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  47.56 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  47.56 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  53.05 
 
 
169 aa  136  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  45.68 
 
 
168 aa  135  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  42.86 
 
 
183 aa  135  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  37.93 
 
 
189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  41.57 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  45.45 
 
 
187 aa  104  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  34.55 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  87.8  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  31.18 
 
 
180 aa  87.8  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  34.36 
 
 
186 aa  85.5  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  34.3 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  31.76 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  29.45 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  31.17 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  32.7 
 
 
162 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  31.82 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  33.75 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  30.77 
 
 
173 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  31.65 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  27.91 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  36.43 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  34.88 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3200  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0643928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  47.8  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  30.49 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  30.32 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1525  hypothetical protein  29.6 
 
 
174 aa  45.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00081824  normal  0.11672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1788  hypothetical protein  26.09 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  27.14 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>