37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1911 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  381  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  77.44 
 
 
164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  77.36 
 
 
161 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  70.2 
 
 
156 aa  193  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  66.67 
 
 
176 aa  191  8e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  64.24 
 
 
162 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  59.35 
 
 
173 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  50.32 
 
 
158 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  50.34 
 
 
162 aa  131  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  37.67 
 
 
151 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  33.11 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0197  hypothetical protein  36.71 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  35.43 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  33.12 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  33.94 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  33.75 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  32.72 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  33.75 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  31.29 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  36.96 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  35.66 
 
 
189 aa  58.2  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  29.12 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  30.63 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  30.3 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  29.56 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  29.56 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  29.56 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  38.46 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  33.82 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3200  hypothetical protein  30.2 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0643928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  32.54 
 
 
167 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  28.66 
 
 
169 aa  51.2  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  30.57 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  29.11 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  27.59 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  32.28 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  26.36 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>