31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1469 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  327  6e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  83.33 
 
 
168 aa  276  7e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  65.66 
 
 
169 aa  223  7e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  64.07 
 
 
168 aa  216  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  64.07 
 
 
168 aa  216  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  64.07 
 
 
168 aa  216  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  62.28 
 
 
168 aa  208  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  60.61 
 
 
169 aa  179  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  50.6 
 
 
172 aa  165  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  50.92 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  50.31 
 
 
185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  50.31 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  43.45 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  36.75 
 
 
189 aa  104  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  37.43 
 
 
189 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  34.38 
 
 
165 aa  94.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  36.31 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  34.15 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  32.32 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  30.72 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  38.75 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  25.49 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  37.17 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  34.52 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  34.18 
 
 
158 aa  44.3  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  31.46 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  32.53 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  31.3 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  32.93 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  29.29 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>