32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3708 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  79.39 
 
 		 167 aa  259  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  78.53 
 
 		 165 aa  256  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  72.39 
 
 		 166 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  47.83 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  41.24 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  36.05 
 
 		 169 aa  97.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  31.82 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  34.97 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  34.97 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  34.36 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  31.79 
 
 		 168 aa  85.1  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  36.31 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  37.01 
 
 		 168 aa  85.1  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  28.93 
 
 		 172 aa  84.7  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  31.79 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  31.79 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  31.79 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  29.94 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  30.26 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  31.5 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  30.15 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  39.64 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  35.9 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  32.76 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  30.94 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  33.62 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3655  hypothetical protein  27.81 
 
 		 162 aa  42  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>