47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4326 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  81.21 
 
 		 167 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  78.53 
 
 		 186 aa  256  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  73.94 
 
 		 166 aa  247  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  51.2 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  44.1 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  36.99 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  34.38 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  34.55 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  34.55 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  33.94 
 
 		 185 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  33.33 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  34.38 
 
 		 167 aa  94.7  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  31.68 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  36.65 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  32 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  32 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  32 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  32.1 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  29.27 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  34.75 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  32.52 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  31.1 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  29.37 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  36.26 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  30.3 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  29.46 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  28.89 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  33.63 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3411  hypothetical protein  28.19 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  30.06 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  31.09 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3851  hypothetical protein  27.08 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3668  hypothetical protein  27.08 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3725  hypothetical protein  27.08 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3655  hypothetical protein  28.68 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  29.33 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  25.87 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0646  hypothetical protein  27.34 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3376  hypothetical protein  27.34 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.879379  hitchhiker  0.00180507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0644  hypothetical protein  27.34 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.257597  hitchhiker  0.000000179995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3997  hypothetical protein  27.34 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0673  hypothetical protein  25.61 
 
 		 162 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0436  hypothetical protein  27.21 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00784425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>