29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0045 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  30.82 
 
 
151 aa  82  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  36.84 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  37.33 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  31.93 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  32.56 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  36.42 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  36.42 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  29.28 
 
 
183 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  34.62 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  29.45 
 
 
161 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  28.96 
 
 
189 aa  60.1  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  29.82 
 
 
176 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  32.33 
 
 
169 aa  55.1  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3200  hypothetical protein  32.19 
 
 
159 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0643928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  32.02 
 
 
186 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  24.57 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  29.68 
 
 
170 aa  52  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  26.95 
 
 
168 aa  48.5  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  26.95 
 
 
168 aa  48.5  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  26.95 
 
 
168 aa  48.5  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  26.59 
 
 
185 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  27.27 
 
 
166 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  26.7 
 
 
185 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  26.59 
 
 
185 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  22.84 
 
 
169 aa  45.4  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  26.09 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  28.99 
 
 
172 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0197  hypothetical protein  27.21 
 
 
182 aa  41.6  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>